Дом-музей открылся 21 января 1941 г. Через три месяца число посетителей превысило 12 тысяч человек, а всего за время функционирования музея его посетило более четырех миллионов человек из 87 государств. Первым директором музея был Ш. Ханафин. Более сорока лет с 1943 г. музей возглавляла Хаят Ахметова. В 1980-х гг. вокруг музея была организована мемориальная зона. Рядом с музеем была воспроизведена часть дореволюционной Уфы. Здесь были построены дома из красного кирпича, проложены улицы с булыжной мостовой, установлены уличные фонари. Эта территория была объявлена памятником архитектуры под охраной государства.