Постановлением Президиума БФ АН СССР от 5 марта 1962 г. № 5. Постановлением Президиума РАН от 16 ноября 1999 г. № 288 Отдел биохимии и цитохимии Уфимского научного центра РАН переименован в Институт биохимии и генетики УНЦ РАН. Постановлением Президиума РАН от 17 декабря 2007 г. № 274 Институт переименован в Учреждение Российской академии наук Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН. Постановлением Президиума РАН № 262 от 13 декабря 2011 г. изменен тип и наименование Института с Учреждения Российской академии наук Института биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН в Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра Российской академии наук. В соответствии с Федеральным законом от 27 сентября 2013 г. № 253-ФЗ «О Российской академии наук, реорганизации государственных академий наук и внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации» и распоряжением Правительства Российской Федерации от 30 декабря 2013 г. № 2591-р Институт передан в ведение Федерального агентства научных организаций (ФАНО России).